Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CDK13Q14004 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CDK13Q14004 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
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