Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
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PDE7AQ13946 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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PDE7AQ13946 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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PDE7AQ13946 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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PDE7AQ13946 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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PDE7AQ13946 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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PDE7AQ13946 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
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PDE7AQ13946 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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PDE7AQ13946 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PDE7AQ13946 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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