Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PKP1Q13835 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PKP1Q13835 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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