Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
LAMB3Q13751 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LAMB3Q13751 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms