Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTMR3Q13615 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR3Q13615 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms