Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NEUROD1Q13562 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NEUROD1Q13562 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms