Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TOP3AQ13472 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TOP3AQ13472 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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