Protein–RNA interactions for Protein: Q13395

TARBP1, Probable methyltransferase TARBP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1Q13395 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TARBP1Q13395 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
TARBP1Q13395 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TARBP1Q13395 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TARBP1Q13395 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TARBP1Q13395 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
TARBP1Q13395 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
TARBP1Q13395 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
TARBP1Q13395 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC34.82■■■■□ 3.17
TARBP1Q13395 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TARBP1Q13395 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TARBP1Q13395 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms