Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CBX3Q13185 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
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