Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDZK1IP1Q13113 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms