Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NPRL3Q12980 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NPRL3Q12980 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms