Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CPSF1Q10570 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
CPSF1Q10570 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CPSF1Q10570 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
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