Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAGPQ0VAQ4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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