Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPIRE1Q08AE8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms