Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC33.81■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC33.8■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC33.8■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC33.79■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC33.79■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC33.76■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC33.76■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
GOLGA3Q08378 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GOLGA3Q08378 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms