Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DDR1Q08345 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DDR1Q08345 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms