Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP3CAQ08209 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP3CAQ08209 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms