Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CKAP4Q07065 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CKAP4Q07065 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms