Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PAX8Q06710 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms