Protein–RNA interactions for Protein: Q05315

CLC, Galectin-10, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCQ05315 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLCQ05315 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCQ05315 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCQ05315 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCQ05315 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCQ05315 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCQ05315 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCQ05315 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCQ05315 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCQ05315 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCQ05315 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCQ05315 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCQ05315 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLCQ05315 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLCQ05315 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLCQ05315 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCQ05315 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCQ05315 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCQ05315 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCQ05315 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCQ05315 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCQ05315 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCQ05315 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCQ05315 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCQ05315 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCQ05315 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCQ05315 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCQ05315 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCQ05315 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCQ05315 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCQ05315 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLCQ05315 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCQ05315 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCQ05315 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCQ05315 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCQ05315 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCQ05315 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCQ05315 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCQ05315 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCQ05315 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLCQ05315 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms