Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT17Q04695 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT17Q04695 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms