Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CAV1Q03135 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAV1Q03135 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms