Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NHLH2Q02577 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NHLH2Q02577 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms