Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTN2Q02246 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTN2Q02246 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms