Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CLTCQ00610 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLTCQ00610 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms