Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPS9P82933 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS9P82933 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS9P82933 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS9P82933 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS9P82933 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS9P82933 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS9P82933 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS9P82933 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS9P82933 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS9P82933 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS9P82933 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS9P82933 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS9P82933 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS9P82933 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS9P82933 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS9P82933 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms