Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX3P78415 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX3P78415 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX3P78415 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX3P78415 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX3P78415 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX3P78415 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX3P78415 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX3P78415 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX3P78415 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX3P78415 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX3P78415 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX3P78415 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IRX3P78415 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX3P78415 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX3P78415 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX3P78415 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX3P78415 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX3P78415 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX3P78415 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX3P78415 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX3P78415 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX3P78415 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX3P78415 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX3P78415 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX3P78415 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX3P78415 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX3P78415 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IRX3P78415 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX3P78415 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX3P78415 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX3P78415 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX3P78415 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX3P78415 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX3P78415 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX3P78415 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX3P78415 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX3P78415 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX3P78415 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IRX3P78415 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IRX3P78415 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRX3P78415 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRX3P78415 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IRX3P78415 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
IRX3P78415 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IRX3P78415 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX3P78415 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms