Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM4P67936 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM4P67936 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM4P67936 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM4P67936 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM4P67936 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM4P67936 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM4P67936 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM4P67936 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM4P67936 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM4P67936 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM4P67936 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPM4P67936 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TPM4P67936 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM4P67936 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM4P67936 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM4P67936 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM4P67936 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM4P67936 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM4P67936 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM4P67936 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM4P67936 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM4P67936 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM4P67936 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM4P67936 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TPM4P67936 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM4P67936 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM4P67936 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM4P67936 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM4P67936 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM4P67936 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM4P67936 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM4P67936 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM4P67936 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM4P67936 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM4P67936 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM4P67936 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM4P67936 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM4P67936 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TPM4P67936 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TPM4P67936 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TPM4P67936 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TPM4P67936 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms