Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSMC1P62191 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMC1P62191 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMC1P62191 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMC1P62191 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMC1P62191 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMC1P62191 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSMC1P62191 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms