Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LMO4P61968 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LMO4P61968 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LMO4P61968 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LMO4P61968 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMO4P61968 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LMO4P61968 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO4P61968 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO4P61968 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO4P61968 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO4P61968 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO4P61968 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO4P61968 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO4P61968 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO4P61968 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO4P61968 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO4P61968 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LMO4P61968 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO4P61968 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO4P61968 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO4P61968 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO4P61968 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO4P61968 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO4P61968 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO4P61968 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO4P61968 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO4P61968 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO4P61968 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO4P61968 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO4P61968 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO4P61968 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LMO4P61968 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms