Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
POLR2FP61218 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR2FP61218 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms