Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ERVFC1-1P60608 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms