Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM3BP58499 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3BP58499 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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FAM3BP58499 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FAM3BP58499 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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FAM3BP58499 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM3BP58499 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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