Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBASH3AP57075 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBASH3AP57075 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms