Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2BFSP57053 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2BFSP57053 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms