Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KPNA1P52294 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KPNA1P52294 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms