Protein–RNA interactions for Protein: P48201

ATP5G3, ATP synthase F(0) complex subunit C3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5G3P48201 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP5G3P48201 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATP5G3P48201 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms