Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DCCP43146 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DCCP43146 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DCCP43146 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DCCP43146 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DCCP43146 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DCCP43146 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DCCP43146 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DCCP43146 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DCCP43146 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DCCP43146 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DCCP43146 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
DCCP43146 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
DCCP43146 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DCCP43146 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DCCP43146 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
DCCP43146 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DCCP43146 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DCCP43146 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DCCP43146 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCCP43146 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCCP43146 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCCP43146 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCCP43146 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCCP43146 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCCP43146 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCCP43146 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCCP43146 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCCP43146 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCCP43146 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCCP43146 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCCP43146 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCCP43146 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCCP43146 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DCCP43146 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DCCP43146 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
DCCP43146 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
DCCP43146 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
DCCP43146 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCCP43146 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCCP43146 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCCP43146 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCCP43146 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCCP43146 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCCP43146 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCCP43146 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCCP43146 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCCP43146 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCCP43146 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCCP43146 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCCP43146 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCCP43146 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DCCP43146 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCCP43146 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCCP43146 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCCP43146 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCCP43146 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCCP43146 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCCP43146 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCCP43146 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
DCCP43146 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCCP43146 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCCP43146 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DCCP43146 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DCCP43146 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DCCP43146 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DCCP43146 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DCCP43146 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DCCP43146 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DCCP43146 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DCCP43146 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
DCCP43146 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DCCP43146 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DCCP43146 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DCCP43146 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DCCP43146 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DCCP43146 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DCCP43146 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DCCP43146 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
DCCP43146 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DCCP43146 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DCCP43146 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DCCP43146 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DCCP43146 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DCCP43146 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DCCP43146 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DCCP43146 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DCCP43146 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DCCP43146 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DCCP43146 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DCCP43146 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DCCP43146 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DCCP43146 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
DCCP43146 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DCCP43146 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DCCP43146 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DCCP43146 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DCCP43146 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DCCP43146 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DCCP43146 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms