Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RPL35P42766 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RPL35P42766 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RPL35P42766 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPL35P42766 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPL35P42766 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPL35P42766 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms