Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASP2P42575 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASP2P42575 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP2P42575 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP2P42575 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP2P42575 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP2P42575 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP2P42575 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP2P42575 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP2P42575 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP2P42575 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP2P42575 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP2P42575 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP2P42575 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP2P42575 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP2P42575 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP2P42575 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP2P42575 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP2P42575 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP2P42575 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP2P42575 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP2P42575 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP2P42575 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP2P42575 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP2P42575 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP2P42575 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP2P42575 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP2P42575 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP2P42575 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP2P42575 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP2P42575 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP2P42575 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP2P42575 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP2P42575 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP2P42575 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP2P42575 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP2P42575 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP2P42575 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP2P42575 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP2P42575 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP2P42575 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP2P42575 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP2P42575 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP2P42575 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP2P42575 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP2P42575 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP2P42575 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP2P42575 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP2P42575 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASP2P42575 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASP2P42575 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CASP2P42575 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP2P42575 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP2P42575 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP2P42575 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP2P42575 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CASP2P42575 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms