Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPHP41219 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPHP41219 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPHP41219 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPHP41219 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPHP41219 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPHP41219 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPHP41219 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPHP41219 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPHP41219 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPHP41219 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPHP41219 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPHP41219 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPHP41219 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPHP41219 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPHP41219 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPHP41219 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPHP41219 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPHP41219 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPHP41219 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPHP41219 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPHP41219 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPHP41219 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPHP41219 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPHP41219 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPHP41219 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPHP41219 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPHP41219 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPHP41219 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPHP41219 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPHP41219 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPHP41219 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPHP41219 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPHP41219 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPHP41219 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPHP41219 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPHP41219 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPHP41219 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPHP41219 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPHP41219 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPHP41219 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPHP41219 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPHP41219 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPHP41219 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPHP41219 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPHP41219 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPHP41219 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPHP41219 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPHP41219 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPHP41219 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPHP41219 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPHP41219 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPHP41219 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPHP41219 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPHP41219 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPHP41219 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPHP41219 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPHP41219 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPHP41219 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPHP41219 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPHP41219 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPHP41219 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPHP41219 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPHP41219 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPHP41219 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPHP41219 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPHP41219 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPHP41219 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPHP41219 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPHP41219 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPHP41219 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPHP41219 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPHP41219 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPHP41219 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPHP41219 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPHP41219 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPHP41219 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPHP41219 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPHP41219 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPHP41219 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPHP41219 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPHP41219 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPHP41219 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms