Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ETFBP38117 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ETFBP38117 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ETFBP38117 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ETFBP38117 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ETFBP38117 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ETFBP38117 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ETFBP38117 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ETFBP38117 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ETFBP38117 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ETFBP38117 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ETFBP38117 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ETFBP38117 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ETFBP38117 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ETFBP38117 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ETFBP38117 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ETFBP38117 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ETFBP38117 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ETFBP38117 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ETFBP38117 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ETFBP38117 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ETFBP38117 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ETFBP38117 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ETFBP38117 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ETFBP38117 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ETFBP38117 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ETFBP38117 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ETFBP38117 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ETFBP38117 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ETFBP38117 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ETFBP38117 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ETFBP38117 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ETFBP38117 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ETFBP38117 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ETFBP38117 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ETFBP38117 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETFBP38117 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETFBP38117 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETFBP38117 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETFBP38117 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETFBP38117 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETFBP38117 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ETFBP38117 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ETFBP38117 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ETFBP38117 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ETFBP38117 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETFBP38117 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETFBP38117 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ETFBP38117 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ETFBP38117 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ETFBP38117 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETFBP38117 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ETFBP38117 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ETFBP38117 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETFBP38117 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ETFBP38117 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ETFBP38117 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ETFBP38117 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETFBP38117 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETFBP38117 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ETFBP38117 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETFBP38117 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ETFBP38117 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETFBP38117 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ETFBP38117 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ETFBP38117 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ETFBP38117 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ETFBP38117 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ETFBP38117 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ETFBP38117 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ETFBP38117 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ETFBP38117 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ETFBP38117 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ETFBP38117 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ETFBP38117 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ETFBP38117 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ETFBP38117 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ETFBP38117 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ETFBP38117 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETFBP38117 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETFBP38117 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETFBP38117 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETFBP38117 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETFBP38117 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETFBP38117 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ETFBP38117 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETFBP38117 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETFBP38117 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETFBP38117 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETFBP38117 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETFBP38117 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ETFBP38117 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ETFBP38117 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms