Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGFBR1P36897 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms