Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CHI3L1P36222 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHI3L1P36222 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHI3L1P36222 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHI3L1P36222 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHI3L1P36222 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHI3L1P36222 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHI3L1P36222 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHI3L1P36222 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHI3L1P36222 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CHI3L1P36222 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CHI3L1P36222 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHI3L1P36222 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHI3L1P36222 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHI3L1P36222 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHI3L1P36222 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHI3L1P36222 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CHI3L1P36222 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CHI3L1P36222 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms