Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPB2P35606 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPB2P35606 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPB2P35606 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
COPB2P35606 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPB2P35606 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPB2P35606 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPB2P35606 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPB2P35606 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPB2P35606 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
COPB2P35606 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
COPB2P35606 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPB2P35606 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPB2P35606 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPB2P35606 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPB2P35606 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPB2P35606 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPB2P35606 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPB2P35606 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPB2P35606 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPB2P35606 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
COPB2P35606 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPB2P35606 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPB2P35606 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPB2P35606 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPB2P35606 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPB2P35606 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COPB2P35606 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB2P35606 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB2P35606 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB2P35606 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB2P35606 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB2P35606 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB2P35606 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB2P35606 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB2P35606 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB2P35606 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB2P35606 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB2P35606 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB2P35606 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB2P35606 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB2P35606 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB2P35606 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB2P35606 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COPB2P35606 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COPB2P35606 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB2P35606 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB2P35606 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB2P35606 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB2P35606 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB2P35606 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB2P35606 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB2P35606 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB2P35606 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB2P35606 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB2P35606 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB2P35606 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB2P35606 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB2P35606 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COPB2P35606 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB2P35606 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB2P35606 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB2P35606 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB2P35606 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB2P35606 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB2P35606 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB2P35606 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB2P35606 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB2P35606 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB2P35606 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB2P35606 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB2P35606 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB2P35606 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB2P35606 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB2P35606 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB2P35606 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COPB2P35606 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPB2P35606 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPB2P35606 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPB2P35606 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPB2P35606 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COPB2P35606 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms