Protein–RNA interactions for Protein: P33076

CIITA, MHC class II transactivator, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIITAP33076 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIITAP33076 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIITAP33076 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CIITAP33076 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CIITAP33076 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIITAP33076 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIITAP33076 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIITAP33076 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIITAP33076 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CIITAP33076 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIITAP33076 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIITAP33076 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIITAP33076 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CIITAP33076 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CIITAP33076 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIITAP33076 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIITAP33076 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIITAP33076 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CIITAP33076 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIITAP33076 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIITAP33076 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIITAP33076 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIITAP33076 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIITAP33076 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CIITAP33076 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CIITAP33076 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIITAP33076 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CIITAP33076 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIITAP33076 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CIITAP33076 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIITAP33076 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIITAP33076 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIITAP33076 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIITAP33076 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIITAP33076 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIITAP33076 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIITAP33076 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CIITAP33076 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIITAP33076 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIITAP33076 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIITAP33076 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIITAP33076 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIITAP33076 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIITAP33076 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CIITAP33076 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIITAP33076 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIITAP33076 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIITAP33076 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIITAP33076 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIITAP33076 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIITAP33076 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIITAP33076 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIITAP33076 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CIITAP33076 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIITAP33076 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIITAP33076 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIITAP33076 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIITAP33076 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIITAP33076 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIITAP33076 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CIITAP33076 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIITAP33076 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIITAP33076 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIITAP33076 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIITAP33076 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIITAP33076 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIITAP33076 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIITAP33076 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIITAP33076 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIITAP33076 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIITAP33076 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIITAP33076 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CIITAP33076 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIITAP33076 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIITAP33076 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIITAP33076 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIITAP33076 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIITAP33076 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIITAP33076 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIITAP33076 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIITAP33076 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIITAP33076 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIITAP33076 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CIITAP33076 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIITAP33076 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIITAP33076 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIITAP33076 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CIITAP33076 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CIITAP33076 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CIITAP33076 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CIITAP33076 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CIITAP33076 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CIITAP33076 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIITAP33076 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIITAP33076 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIITAP33076 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIITAP33076 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CIITAP33076 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIITAP33076 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CIITAP33076 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms