Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP2P32456 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP2P32456 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP2P32456 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP2P32456 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP2P32456 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP2P32456 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBP2P32456 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBP2P32456 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBP2P32456 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBP2P32456 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP2P32456 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP2P32456 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP2P32456 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP2P32456 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP2P32456 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP2P32456 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP2P32456 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP2P32456 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP2P32456 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP2P32456 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP2P32456 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP2P32456 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP2P32456 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBP2P32456 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP2P32456 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP2P32456 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP2P32456 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP2P32456 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP2P32456 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP2P32456 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP2P32456 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP2P32456 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP2P32456 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP2P32456 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP2P32456 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP2P32456 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GBP2P32456 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBP2P32456 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms