Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABRA5P31644 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABRA5P31644 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms