Protein–RNA interactions for Protein: P26447

S100A4, Protein S100-A4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A4P26447 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A4P26447 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A4P26447 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A4P26447 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A4P26447 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
S100A4P26447 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
S100A4P26447 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
S100A4P26447 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
S100A4P26447 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A4P26447 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A4P26447 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A4P26447 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A4P26447 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A4P26447 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A4P26447 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A4P26447 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
S100A4P26447 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms