Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRDP23468 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTPRDP23468 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
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